Biology
Permanent URI for this collection
Browse
Recent Submissions
- ItemMedicinal Plants as a Source of Inhibitors of the Digestive Enzymes: Alpha-glucosidase, Alpha-amylase and Pancreatic Lipase(Raghad Albzoor, 2019-03-21) Albzoor, RaghadObesity and diabetes are reaching epidemic proportions all over the world in the twenty-first century. Herbal medicine has been suggested as an alternative source of potentially useful antihyperlipidemic and antihyperglycemic agents. The objective of this study was to assess in vitro the inhibitory activity of selected local anti-diabetic and anti-obesity medicinal plants on carbohydrate and lipid digestive enzymes namely, α-glucosidase, pancreatic α-amylase, and pancreatic lipase. The inhibitory activities of ethanol: water (50%:50%) six herbal extracts (namely: Allium sativum, Allium cepa, Atriplex halimus, Cinnamomum cassia, Olea europaea and Trigonella foenum-graecum) were evaluated using the enzymatic colorimetric assays. Among the six herbal extracts (at a concentration of 200 µg/ml), only A. sativum (bulb) showed an inhibitory activity against the intestinal sucrase (α-glucosidase) with a percentage inhibition of 46.74±11.55% (p<0.01). For pancreatic lipase only C. cassia (bark) showed an inhibitory activity with a percentage inhibition of 14.33±4.98% (p<0.05). The highest inhibitory percentage was received by C. cassia (bark) and O. europaea (leaves) on pancreatic α-amylase with IC50 value 24±3.01 and 192.94±6.4 µg/mL, respectively. Taken together, these results indicate that the above mentioned plants can be potentially useful to treat diabetes or obesity. Further studies are needed for identification of the chemical composition and therapeutic effect of these plants and to identify the active ingredients responsible for these activities. In vivo tests are also required to examine other mechanisms responsible for the activity of these plants as antiobesity and antidiabetic agents.
- ItemBiochemical and Molecular Evaluation of the Plant Ecballium elaterium Extract Effects on Escherichia coli(Wafa Jarrah Abdat, 2018-05-02) Abdat, WafaEcballium elaterium plant is traditionally used in several countries around the world for the treatment of various illnesses including jaundice and rhinosinusitis. The present study was conducted to investigate the antimicrobial activity of fruit and leaf ethanolic extracts of E. elateruim on clinical and reference strains of E. coli. Microbroth dilution method indicated that ethanolic leaf and fruit extracts of E. elaterium exhibited the same degree of antimicrobial activity against both tested E. coli strains with an MIC value of 25mg/ml. The effect of E. elaterium ethanolic extracts on these strains was also examined at the molecular level using ERIC-PCR. SDS-PAGE technique was also carried out to examine gene expression of total cellular proteins under the same conditions. Results of ERIC-PCR and SDS-PAGE showed alterations in DNA and protein profiles of both tested E. coli strains treated with fruit and leaf extracts compared with untreated control. The alterations ranged between decreased or increased intensity of some bands, absence or appearance of new amplified fragments. Among the changes that occurred in ERIC-PCR profile, an amplified fragment with amplicon size 450-bp disappeared after 6 and 24h from reference strain treated with 6 mg/ml fruit extract compared with untreated control. The band which had an amplicon size of about 550-bp was faint after 2h in clinical strain treated with 25 mg/ml ethanolic leaf extract in comparison with untreated control. In addition, after 6h treatment of reference E. coli with 25 mg/ml leaf extract appearance of extra new bands at Rf values of approximately 0.45 and 0.47 was recorded compared with untreated control in SDS-PAGE profile. SDS-PAGE profile also revealed the increase in the intensity of bands at approximate Rf values of 0.15 and 0.7 compared after 6 h treatment of clinical E. coli with 10 and 6 mg/ml fruit extract with untreated control. Moreover, increased concentrations of E. elaterium extracts and increased time intervals seems to yield a more profound increase in total protein concentrations in both tested E. coli strains. Such findings strongly indicate the genotoxic effects of E. elaterium extracts on both E. coli strains. The findings draw attention to the unsafe improper use of E. elaterium extracts in folkloric medicine and also point out the capability of using E. elaterium to treat E. coli infections. More studies are required to find out the exact mechanisms responsible for the observed genotoxicity.
- ItemMolecular Determination of Prevalence of Certain Urogenital Bacterial Infections among Patients with Infertility Problems(جامعة النجاح الوطنية, 2019-07-02) عاشور, انتصارجامعة النجاح الوطنية كلية الدراسات العليا التحديد الجزيئي لمدى انتشار بعض أنواع الإلتهابات البكتيريه في الجهازالبولي والتناسلي لدى المرضى الذين يعانون من مشكلة العقم إعداد إنتصار خليل حسني عاشور إشراف د. معتصم المصري د. أشرف صوافطة قدمت هذه الأطروحة استكمالا لمتطلبات الحصول على درجة الماجستير في العلوم الحياتية بكلية الدراسات العليا في جامعة النجاح الوطنية في نابلس، فلسطين. 2019م التحديد الجزيئي لمدى انتشار بعض أنواع الإلتهابات البكتيريه في الجهاز البولي والتناسلي لدى المرضى الذين يعانون من مشكلة العقم إعداد إنتصار خليل حسني عاشور إشراف د. معتصم المصري د. أشرف صوافطة الملخص الخلفية العلمية: تعد إلتهابات الجهاز التناسلي من أهم العوامل والأسباب التي تؤدي إلى مشاكل العقم حول العالم، والتي تؤثر علا كلا الجنسين، وتعد بكتيريا المفطورة البشرية، وبكتيريا الميورة الحالة لليوريا، والمايكوبلازما التناسلية عاملا في مشاكل الجهار التناسلي، حيث يصعب تشخيصها وزراعتها ويعد تفاعل البوليمريز من أهم الطرق في الكشف عن وجود هذه البكتيريا الأهداف: هدفت هذه الدراسة إلى الكشف عن مدى تواجد كل من بكتيريا المفطورة البشرية، وبكتيريا الميورة الحالة لليوريا، والمايكوبلازما التناسلية لدى المرضى الذين يعانون من مشاكل العقم بإستخدام تقنية تفاعل البوليمريز، في مركز الشنار في مدينة نابلس. الطريقة: تضمنت الدراسة مئة وثلاث مرضى زاروا عيادة الشنار وشخصوا بالعقم خلال الفترة ما بين كانون الثاني وتشرين أول من سنة 2018. جمعت العينات (110 عينة) بإشراف مختص وتحت إشراف الطبيب. خضعت العينات للفحص الجزيئي باستخدام تقنية البوليمريز للكشف عن وجود بكتيريا المفطورة البشرية، وبكتيريا الميورة الحالة لليوريا، والمايكوبلازما التناسلية. وقد استخلص الحمض النووي من العينات المختلفة ثم أخضع لتفاعل البوليمريز، بالإضافة إلى عملية الكشف عن تسلسل القواعد النيتروجينية للحمض النووي المستخرج من بعض العينات التي كانت نتيجتها إيجابية في تفاعل البوليمريز، ومن ثم المعلومات الناتجة حللت بواسطة برنامج إحصائي. النتائج: من بين مئة وعشر عينات خضعت للفحص 35 (31.8%) كانت نتيجتها إيجابية لنوع واحد من البكتيريا المدروسة على الأقل˛ بحيث كانت نسبة بكتيريا الميورة الحالة لليوريا 11 (10%)، وكانت نسبة بكتيريا المفطورة البشرية 16 (14.6%)، بينما كانت نسبة المايكوبلازما التناسلية 8 (7.3%). اختلف وجود الإلتهاب البكتيري لهذه البكتيريا عديمة الجدار بين عينات الجهاز التناسلي وعينات الجهاز البولي بحيث تواجد 18.9% منها في عينات الجهاز البولي (بول) وفي عينات المسحات المهبلية (31.3%) والسوائل المنوية (40.4%)، ومن الجدير بالذكر أن تواجد البكتبريا آنفة الذكر في السائل المنوي كان ذا دلالة إحصائية .(P=0.023) أختلف توزيع البكتيريا المدروسة بين المرضى الذين يعانون من عقم أولي والمرضى الذين يعانون من عقم ثانوي، بحيث كانت نسبة تواجد جميع أنواع البكتيريا المدروسة عند المرضى الذين يعانون من عقم أولي أكبر من نسبتها عند المرضى الذين يعانون من عقم ثانوي. شكل الذكور ما نسبته 66% من كلي عدد المرضى، وكانت نسبة الإصابة بإلتهاب بكتيري للذكور (41.2%) أعلى منه للإناث (20 %) وقد تواجدت بكتيريا المفطورة بنسبة أكبر لدى جميع الفئات العمرية بالمقارنة مع الميورة الحالة لليوريا والمايكوبلازما التناسلية، ولدى المرضى بمختلف أنواع المهن، بالإضافة إلى تواجدها بنسبة أكبر لدى جميع المرضى المدخنين. أظهرت شجرة النشوء والتطور لبكتيريا الميورة الحالة لليوريا أن سلالتا هذا البحث تنتميان لسلالتين قريبتين وتنحدران من نفس المنشـأ، وقد كانت أقرب إ لى سلالة Ureaplasma urealyticum 23 (serovar 2).، بالإضافة إلى ذلك أظهرت شجرة النشوء والتطور لكل من بكتيريا المفطورة البشرية وبكتيريا المايكوبلازما التناسلية، بحيث كانت عزلة المايكوبلازما أقرب إلى Mycoplasma genitalium strain G-37، وكانت عزلة المفطورة البشرية أقرب إلى سلالة .Mycoplasma hominis strain TO0613 الاستنتاج: الإلتهابات اللتناسلية البولية بسبب كل من المفطورة البشرية والميورة الحالة لليوريا والمايكوبلازما التناسلية تلعب دوررا مهما كمسبب للعقم للمرضى بمختلف أعمارهم، وبغض النظر عن جنسهم ونوع وظيفتهم، لذا مزيد من الاهتمام والتركيز يجب أن يتبنى من مراكز العقم و المختصين، بحيث نوظف التقنيات الجزيئية في التشخيص للكشف عن هذه الأنواع من البكتيريا.
- ItemMolecular Phylogenetic Relationship among Closely Related Species of the Clover Genus (Trifolium – Leguminosae) in Palestine / West Bank(جامعة النجاح الوطنية, 2017-09-17) Hassan, RanaLeguminosae family is the third largest family of angiosperms; which comprises three sub-families: Caesalpinioideae, Mimosoideae and Papilionoideae. Legumes are flowering plants in Leguminosae family that include a large number of species. Trifolium L. (Clover genus, True Clover) is one of the most important genera in legumes with agricultural values. A Mediterranean region contains the highest biological diversity due to the variation in Mediterranean climate. The native distribution of Clover genus is found there. To resolve the conflicts in the morphological characters in some of the closely related species of Trifolium, it was necessary to use molecular markers. Internal Transcribed Spacer (ITS) regions of the nuclear ribosomal DNA (nrDNA) are the most widely used marker in plant research. They have been proved to be useful source of information for phylogenetic studies in many angiosperm families including Leguminosae. Fresh specimens of different species of Trifolium were collected during the flowering period (March – May 2017) from different locations in Palestine/West Bank. Then a representative plant specimen of each species was deposited at An-Najah National University Herbarium. Depending on Flora Palaestina, and using of Stereo microscope, the collected samples were identified and classified based on their morphological characteristics. CTAB extraction protocol was followed for plant genomic DNA extraction. The ITS regions (ITS-1 spacer, 5.8S rDNA and ITS-2 spacer) were amplified using universal primers. Phylogenetic tree was constructed for the 12 classified samples that belong to Clover genus (Trifolium L.) using Neighbor-Joining method and Salvia candidissima was used as the out-group. Kimura's 2-parameter method was used to compute Pair-wise distances. All DNA sequences that were used in the study were deposited at the GeneBank database under accession numbers. Molecular ITS sequence analysis of both T.purpurem and T.dasyurum showed that they are identical species, since they have identical ITS sequences (0% bp differences) and were clustered together in the same clade I/ sub- clade Ia. This coincides with the high resemblance of their morphological characters. T.campestre and T.grandiflorum could be regarded taxonomically as one species, since they also have identical ITS sequence (0% bp differences) and were clustered together in the same clade II/ sub-clade IIb in the constructed phylogenetic tree. Based on this study, it is recommended to identify both T.purpurem and T.dasyurum as same species. Accordingly depending on the nomenclature rules T.dasyurum (1832) can be considered as synonym to T.purpurem (1807), which can be referred as the valid name of that species. Similarly this can be applied to both T.campestre (1804) and T.grandiflorum (1767). The former one could be regarded as synonym to T.grandiflorum which could be taken as the valid name. In addition, the current conducted traditional morphological and molecular taxonomical study is the first of its type that was able to highlight the phylogenetic relationship among closely related species of the genus Trifolium in Palestine/West Bank. This paves the way for future in-depth researches on different more species of the same genus. In addition, using other molecular markers could reveal more clarification of the taxonomy of Trifolium different species.
- ItemMOLECULAR DETECTION OF CITRUS VIROIDS IN WEST BANK(جامعة النجاح الوطنية, 2022-02-11) Abualrob, AswarPalestine as many of developing countries; its economy depends on many factors including agriculture sector. The citrus cultivated areas for the year 2012/2013, in the West Bank reached approximately 9.831 hectares, which constituted to 9.2% of the total area of fruit trees with annual production of approximately 4% of total production. Citrus are natural hosts to several pathogens like: bacteria, fungi, viruses, and virus-like (viroid). Many of which have an economic ipmpact on the crop A minimum of five viroid species of Pospiviroidae family that are found in citrus trees. The purpose of this study was detection of five citrus viroids (CVdIII , CVdIV , CEVd, HSVd and CBLVd) in West bank by molecular means. Field surveys were conducted during august 2020; where a total of 42 samples were collected from citrus collection plot in NRAC –Jenin. Samples screening for presence of any viroids species were carried out by two-steps RT-PCR. Five viroid were detected by RT-PCR for the first time in West bank. The incidence of Citrus viroid III, Citrus exocortis viroid (CEVd), and Citrus viroid IV were found 35.7%, 23.8%, and 16.6% respectively. Meanwhile Hop stunt viroid and Citrus bent leaf viroid were found in 9.5% and 7%. Portion of CEVd, CVdIII and CVdIV were sequenced to be later deposited in gene bank as Palestinian isolate.