Molecular Genetic Assessment of Selected Thyme Species in Palestine Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD

Simple item page
dc.contributor.advisorDr. Raed Alkowni
dc.contributor.authorEsra` Madhat Mas`od Solyman
dc.date.accessioned2017-05-03T09:32:07Z
dc.date.available2017-05-03T09:32:07Z
dc.date.issued2013
dc.description.abstractTraditionally, subjective methods based on the morphological features such as shape, color, texture, and odor are used for the discrimination of herbal medicines. However, these methods fail to provide an accurate for discrimination and authentication. The use of highly discriminatory methods for the identification and characterization of genotypes is essential for plant production and their appropriate use. The RAPD (Random amplified polymorphic DNA) method was used for the genetic fingerprinting of five Palestinian thymes: Thymus syriacus, Thymus fruticosus, Thymus incanus, Thymus majorana, and Thymus capitatus. Among the polymerase chain reaction (PCR)-based molecular techniques, random amplified polymorphic DNA (RAPD) is convenient in performance and does not require any information about the DNA sequence to be amplified. Due to its procedural simplicity, RAPD was used as molecular markers for taxonomic and systematic analyses of plants. After DNA extraction from thyme species, ten decamer primers were tested for their ability to amplify DNA from selected thyme species using RAPD-PCR. The RAPD-PCR products were separated by gel electrophoresis, and then the data were analyzed. Eight of these primers were found to produce fragments for the studied plant species (OPD-19, OPH-02, OPAN-08, PH-01, KFP-6, OPAE-07, OPJ-06 and OPG-66). Three of these primer (OPD-19, OPH-02 and OPAN-08) were polymorphic and generated 78.6% average polymorphism across five Thyme species. The primer OPD-19, and OPH-02 was capable of differentiating thyme species from each other. Pairwise similarity of banding pattern between the studied plant species ranged from 0.18 to 0.67 for the three primers (OPD-19, OPH-02, and OPAN-08). In this study, genetic diversity of five Palestinian Thyme species was revealed successfully using RAPD markers that could be useful in Thyme-breeding programs Palestine. Also these markers could assist in the identification of components in herbal medicine complexes leading to significant improvement in quality control.en
dc.description.abstractتقليديا، الطرق الموضوعية استندت إلى الميزات الشكلية مثل: الشكل، واللون، والملمس، والرائحة للتمييز بين النباتات الطبية. ومع ذلك، هذه الأساليب صعبة التطبيق بدقة للتمييز والتوثيق. ان استخدام أساليب عالية التمييز لتحديد وتوصيف الأنماط الجينية أمر ضروري للإنتاج النباتي والاستخدام الانسب لهم. لقد تم استخدام تقنية المضاعفة العشوائية متعددة الاشكال للحمض النووي DNA (RAPD) لأخذ البصمات الجينية لخمس أنواع من الزعتر الفلسطيني:Thymus syriacus, Thymus fruticosus, Thymus incanus, Thymus majorana, and Thymus capitatus. من بين التقنيات الجزيئية القائمة على تفاعل البلمرة سلسلة (PCR) DNA ، تقنية(RAPD) التي تعتبر مريحة في الأداء ولا تتطلب أي معلومات عن متسلسلة الحمض النووي ليتم تضخيمها. نظرا لبساطتها الإجرائية، فإن تقنية RAPD تستخدم كسمات جزيئية للتصنيف والتحليلات المنهجية للنباتات. فبعد استخراج الحمض النووي من الأنواع الخمسة للزعتر، تم اختبار 10 " نواشئ عشرية" لقدرتها على تضخيم الحمض النووي من أنواع الزعتر الخمسة باستخدام .RAPD-PCR ثم تم فصل منتجات RAPD-PCR بواسطة الهجرة الكهربائية في الهلام، ليتم تحليل البيانات بعد ذلك. لقد تم العثور على ثمانية من هذه النواشئ قادرة على إنتاج قطع من أنواع النباتات الخاضعة للدراسة، وهم (OPD-19، OPH-02، OPAN-08، PH-01، KFP-6، OPAE-07، OPJ-06, OPG-66)، ثلاثة من تلك النواشئ(OPD-19, OPH-02, OPAN-08) كانت متعدد الأشكال بمتوسط 78.6% لجميع أنواع الزعتر الخمسة. لقد كانا النواشئ OPD-19، و OPH-02 قادران على التمييز بين أنواع الزعتر الخاضعة للدراسة. وقد تراوح "التماثل الزوجي" في نمط النطاقات بين الأنواع النباتية التي درست من 0,18 الى 0,67 لثلاث نواشئ وهي (OPD-19، OPH-02، (OPAN-08. في هذه الدراسة، تم الكشف عن التنوع الوراثي لخمسة أنواع من الزعتر الفلسطيني بنجاح باستخدام تقنية RAPD، لذلك سوف تكون هذه الدراسة قيمة لبناء أي برنامج اكثار للزعتر في فلسطين. وكذلك تمكن أيضا من استخدام هذه العلامة لتحديد طرق للكشف عن مكونات الأدوية العشبية المخلوطة، مما سيسهم إلى حد كبير في مراقبة الجودة.ar
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.11888/8437
dc.titleMolecular Genetic Assessment of Selected Thyme Species in Palestine Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPDen
dc.titleالتقييم الجيني الجزيئي لأنواع مختارة من الزعتر في فلسطين باستخدام تقنية المضاعفة العشوائية متعددة الاشكال للحمض النووي DNA (RAPD)ar
dc.typeThesis
Files
Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
esra solyman_0.pdf
Size:
880.13 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Download
Collections
Biology