Prevalence and Molecular Characterization of β-Lactamases in Clinical Isolates of Klebsiella pneumoniae from North of Palestine
dc.contributor.advisor | Dr. Ghaleb Adwan | |
dc.contributor.author | Doa'a Faisal Rabaya' | |
dc.date.accessioned | 2017-05-03T09:32:09Z | |
dc.date.available | 2017-05-03T09:32:09Z | |
dc.date.issued | 2016 | |
dc.description.abstract | Fifty-one clinical isolates of Klebsiella pneumoniae were obtained from different hospitals in Jenin, Nablus and Tulkarem districts-Palestine, during September - December 2015. Identification of isolates were confirmed in Microbiology laboratories at An-Najah National University-Nablus, Palesine; using different tests such as growth on MacConkey, detection of growth at 5°C and 44.5°C, Gram stain reaction, motility test and other biochemical tests were used such as Indole test and Voges-Proskauer test. Multiplex PCR was used to detect and determine the molecular epidemiology of MBL, ESBL and AmpC β-lactamase producing K. pneumoniae isolates. Results showed that the prevalence of possible ESBL, MBL and AmpC β-lactamase using multiplex PCR technique were 92.2%, 9.8 and 3.9%, respectively. TEM gene was the most dominant (72.5%) among the K. pneumoniae isolates. Other genes were (0.0%), (17.6%) and (31%) for CTX-M, SHV and OXA genes, respectively. For MBLs and AmpC β-lactamases (9.8%) NDM and (3.9%) DHA genes were detected, respectively, among the collected isolates. Six isolates (11.8%) showed coexistence with at least another type of β-lactamases. Molecular analysis and phylogenetic relationships showed that all sequenced TEM, SHV, OXA, NDM and DHA genes belonged to TEM-1, SHV-1, OXA-1, NDM-1 and DHA-1, respectively. Results of the current study showed that all K. pneumoniae isolates were sensitive to Imipenem (100%), while 68.6% and 54.9% of the isolates were resistant to Meropenem and Cefotaxime, respectively. A total of 26 of K. pneumoniae isolates (51%) harbored class 1 integrons, whereas other classes were not detected. All integrons were detected in K. pneumoniae isolates carrying β-lactamase genes. ERIC-PCR typing of 40 clinical isolates of K. pneumoniae harbored β-lactamase genes were genetically diverse and consisted of a heterogeneous population with a total of 16 ERIC PCR profiles (clusters) at a 50% similarity level. Results of the current research showed high occurrence of β-lactamases among clinical isolates of K. pneumoniae in Palestine. To restrict the further spread of β-lactamases producing K. pneumoniae isolates within hospitals in this country, we recommend the continuous monitoring and surveillance of the prevalence, proper prevention practices and effective antimicrobial drugs use. | en |
dc.description.abstract | تم الحصول على 51 عزلة من بكتيريا الكليبسيلا من مستشفيات مختلفة من منطقة جنين، نابلس وطولكرم/ فلسطين خلال الفترة ما بين أيلول إلى كانون الأول من العام 2015. أظهرت النتائج أن انتشار كل من ESβL، MBLو AmpC β-lactamase باستخدام تقنية PCR كان بنسبة 92.2%، %9.8 و 3.92% على الترتيب. كما أظهرت النتائج أن جين TEM كان سائدا بنسبة 72.5% بين بكتيريا الكليبسيلا التي تحمل جينات ESβL. أما الجينات الأخرى وهي CTX-M ، SHV و OXA فكانت النسب 0.0%، 17.6% و31% على الترتيب. بينما في AmpC β-lactamases فقد تم تحديد جين DHA فقط، وكانت نسبة انتشاره %3.9. وأظهرت النتائج أن العينات المنتجة ل MBL كانت تحمل جين NDM بنسبة انتشار .%9.8 بالإضافة إلى أن 50.98% من العينات كانت تحمل النوع 1 من integrons ولم يظهر النوع 2، 3 أو4 في أي من العينات. أظهر التحليل الجزيئي باستخدام طريقة شجرة النشوء والتطور أن جميع تسلسلات جينات TEM، SHV، OXA ،NDM و DHA التي تم فحص تسلسل النيوكليتيدات لها تعود إلى TEM-1، SHV-1،OXA-1 ،NDM-1 و DHA-1 على الترتيب. كما أظهرت نتائج ERIC-PCR أن هذه السلالات متنوعة. نتائجنا تؤكد على الحاجة إلى المراقبة المستمرة ومراقبة الانتشار والرقابة السليمة وممارسات الوقاية واستخدام المضادات الحيوية الفعالة سيحد من انتشار المزيد من السلالات المنتجة ل AmpC β-lactamases ،ESβLs و MBLsداخل المستشفيات في فلسطين. | ar |
dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.11888/8455 | |
dc.title | Prevalence and Molecular Characterization of β-Lactamases in Clinical Isolates of Klebsiella pneumoniae from North of Palestine | en |
dc.title | الوصف الجزيئي ومدى انتشار النوع البكتيري كليبسيلا الرئوية المنتجة للإنزيمات المحللة للمضادات الحيوية من نوع بيتا لاكتام في شمال فلسطين | ar |
dc.type | Thesis |
Files
Original bundle
1 - 1 of 1
Loading...
- Name:
- Doa'a Faisal Rabaya'.pdf
- Size:
- 2.05 MB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description: