Serological and Molecular Detection of Potato virus Y (PVY) in West Bank
Date
2016
Authors
Nibal Yahya Lutfi Khudiesh
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Potato virus Y (PVY) is widely distributed virus in potato (Solanum tuberosum) all over the world as ranks the fifth among the top ten of the most economically damaging plant viruses worldwide. Within the scope of collecting data of phytoviruses in Palestine, this study was conducted to reveal the incidence of PVY virus on potatoes collected from the main growing fields of potato in West Bank-Palestine, using serological methods. Besides, biological (Field inspections and mechanical inoculation) with molecular tools (RT-PCR) were used as well. A total of 255 potato leaf samples from inspected 40 fields of different regions in West Bank were collected during the 2014 / 2015 growing seasons of potato. All samples were tested for PVY by Double Antibody Sandwich Enzyme Linked Immunosorbent Assay (DAS-ELISA), and at least 5 of these samples were further analyzed by Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) using degenerate primers. The obtained results of the field surveys revealed a variety of symptoms such as yellowish-green mosaic, stunting, rugosity, wilting and general yellowing, which were observed in some fields; indicating the presence of putatively viral diseases. By using DAS-ELISA, the incidence of the PVY virus was detected at an average of 15.29 %; confirmed by bioassay tests and RT-PCR analysis. Surprisingly, all infected potatoes were recorded on Spunta variety except one sample from (Mondial), meanwhile the most area where the virus had been detected in its fields found in Nablus region (48%). That presence of the virus in the fields of the main growing areas, as this study reported, should be alarming and need actions to prevent its spread. Also these results are considered important in providing a platform helpful for further studies to create proper management approach to control plant viral diseases in Palestine.
فيروس البطاطا "واي" (PVY) يعتبر من أكثر الفيروسات النباتية التي تصيب نبات البطاطا (Solanum tuberosum) حول العالم, حيث يحتل المرتبة الخامسة من بين العشرة الأوائل من الفيروسات النباتية الأكثر ضرراً اقتصادياً في جميع أنحاء العالم. في نطاق جمع البيانات حول الفيروسات النباتية في فلسطين، قد أجريت هذه الدراسة للكشف عن الإصابة بفيروس البطاطا "واي" في أهم مناطق زراعة محصول البطاطا في الضفة الغربية - فلسطين، وذلك باستخدام الأساليب السيرولوجية بشكل أساسي الى جانب استخدام الأساليب البيولوجية (الكشف عن الأعراض والتلقيح الميكانيكي) بالإضافة إلى التحليل الجزيئي . تم جمع (255) عينة من أوراق البطاطا المزروعة في (40) حقل متوزعة على مناطق مختلفة في الضفة الغربية خلال مواسم الزراعة لعامي .2014/2015 وقد تم فحص جميع العينات باستخدام الفحص السيرولوجي، وتم أخذ (5) من هذه العينات على الأقل وفحصها على المستوى الجزيئي (RT-PCR) وكشفت النتائج التي تم الحصول عليها من المسوحات الميدانية لحقول البطاطا مجموعة متنوعة من الأعراض الفيروسية مثل الفسيفساء, التقزم، التغضن، الذبول والاصفرار العام، والتي لوحظت في بعض الحقول مشيرة إلى وجود الأمراض الفيروسية. حسب الفحص السيرولوجي تبين أن النباتات التي تم جمعها مصابة بفيروس البطاطا "واي" بمعدل (15.29%)، وقد تم تأكيد وجود الفيروس باستخدام كلا من الفحص البيولوجي والجزيئي لبعض النباتات التي تم كشف إصابتها بالفيروس تبعاً لنتيجة الفحص السيرولوجي. والمثير للدهشة، أن جميع عينات نبات البطاطا المصابة كانت من صنف سبونتا عدا عينة واحدة من صنف مونديال، إضافة إلى ذلك أن أعلى نسبة إصابة بالفيروس قد سجلت في الحقول التابعة لمنطقة نابلس بنسبة(48%) . إن انتشار الفيروس في الحقول الزراعية الرئيسية لزراعة محصول البطاطا كما ذكرت هذه الدراسة ينبغي أن يكون مقلقاً ودافعاً لوضع إجراءات لمنع انتشاره. كما تعتبر هذه النتائج مهمة في توفير قاعدة بيانات مفيدة لمزيد من الدراسات لإنشاء نهج إدارة سليم للسيطرة على الأمراض الفيروسية النباتية في فلسطين.
فيروس البطاطا "واي" (PVY) يعتبر من أكثر الفيروسات النباتية التي تصيب نبات البطاطا (Solanum tuberosum) حول العالم, حيث يحتل المرتبة الخامسة من بين العشرة الأوائل من الفيروسات النباتية الأكثر ضرراً اقتصادياً في جميع أنحاء العالم. في نطاق جمع البيانات حول الفيروسات النباتية في فلسطين، قد أجريت هذه الدراسة للكشف عن الإصابة بفيروس البطاطا "واي" في أهم مناطق زراعة محصول البطاطا في الضفة الغربية - فلسطين، وذلك باستخدام الأساليب السيرولوجية بشكل أساسي الى جانب استخدام الأساليب البيولوجية (الكشف عن الأعراض والتلقيح الميكانيكي) بالإضافة إلى التحليل الجزيئي . تم جمع (255) عينة من أوراق البطاطا المزروعة في (40) حقل متوزعة على مناطق مختلفة في الضفة الغربية خلال مواسم الزراعة لعامي .2014/2015 وقد تم فحص جميع العينات باستخدام الفحص السيرولوجي، وتم أخذ (5) من هذه العينات على الأقل وفحصها على المستوى الجزيئي (RT-PCR) وكشفت النتائج التي تم الحصول عليها من المسوحات الميدانية لحقول البطاطا مجموعة متنوعة من الأعراض الفيروسية مثل الفسيفساء, التقزم، التغضن، الذبول والاصفرار العام، والتي لوحظت في بعض الحقول مشيرة إلى وجود الأمراض الفيروسية. حسب الفحص السيرولوجي تبين أن النباتات التي تم جمعها مصابة بفيروس البطاطا "واي" بمعدل (15.29%)، وقد تم تأكيد وجود الفيروس باستخدام كلا من الفحص البيولوجي والجزيئي لبعض النباتات التي تم كشف إصابتها بالفيروس تبعاً لنتيجة الفحص السيرولوجي. والمثير للدهشة، أن جميع عينات نبات البطاطا المصابة كانت من صنف سبونتا عدا عينة واحدة من صنف مونديال، إضافة إلى ذلك أن أعلى نسبة إصابة بالفيروس قد سجلت في الحقول التابعة لمنطقة نابلس بنسبة(48%) . إن انتشار الفيروس في الحقول الزراعية الرئيسية لزراعة محصول البطاطا كما ذكرت هذه الدراسة ينبغي أن يكون مقلقاً ودافعاً لوضع إجراءات لمنع انتشاره. كما تعتبر هذه النتائج مهمة في توفير قاعدة بيانات مفيدة لمزيد من الدراسات لإنشاء نهج إدارة سليم للسيطرة على الأمراض الفيروسية النباتية في فلسطين.